Em foco directo Júpiter fica pequenino porque normalmente as ópticas das webcam's utilizam uma distância focal muito curta, daí em trabalhares com ela em modo afocal, ficas sujeita ao campo aparente do teu sensor, mais o campo aparente da tua ocular.
Por isso, em fotografia planetária, normalmente utiliza-se o método de projecção em Foco Principal no telescópio. Ou seja, retira-se a ocular e toda a óptica que envolve a webcam ou outro equipamento de aquisição de imagens, fazendo com que o telescópio, seja uma objectiva da tua câmara. Ficando assim a imagem mais fiel às características do teu sensor CCD e do teu telescópio.
Para desmontar o Avi em em frames normalmente eu uso o software AutoStakkert:
http://www.autostakkert.com/Aqui, costumo fazer a selecção de pontos de alinhamento e o respectivo stack. Depois guardo o output em Tiff e passo-o para o Registax:
http://www.astronomie.be/registax/ , onde aqui mexo nos Wavelet's que é o que realmente vai dar detalhes à imagem.
O stack das imagens no Autostakkert é feito automaticamente, de modo que não precisas de andar a alinhar à mão os frames.
Espero ter ajudado. Mais alguma coisa, apita!